飲用水中常存在大量的細菌和病毒，特別是受到污染的情況下，飲水常常是畜禽呼吸道和消化道疾病最主要傳播途徑。為了杜絕經水傳播疾病的發生和流行，保證畜禽的健康，養殖場可以將水經消毒處理后再讓畜禽飲用。
一、飲用水的消毒方法
水的消毒方法分為兩類：物理法和化學法。
( 1 ）物理消毒法物理法有煮沸消毒法、紫外線消毒法、超聲波消毒法、磁場消毒法、電子消毒法等。
( 2 ）化學消毒法使用化學消毒劑對飲用水進行消毒，是養殖場飲用水消毒的常用方法。
二、飲水消毒常用的化學消毒劑
理想的飲用水消毒劑應無毒、無刺激性，可迅速溶于水中并釋放出殺菌成分，對水中的病原性微生物殺滅力強，殺菌譜廣，不會與水中的有機物或無機物發生化學反應和產生有害有毒物質，不殘留，價廉易得，便于保存和運輸，使用方便等。目前常用的飲用水消毒劑主要有氯制劑、碘制劑和二氧化氯。
( 1 ）氯制劑在養殖場常用于飲用水消毒的氯制劑有漂白粉、二氯異氰尿酸鈉、漂白粉精、氯氨T 等，其中前兩者使用較多。漂白粉含有效氯25 ％～32 % ，價格較低，應用較多，但其穩定性差，遇日光、熱、潮濕等分解加快，在保存中有效氯含量每日損失量在0 . 5 %～3.0％，從而影響到其在水中的有效消毒濃度；二氯異氰尿酸鈉含有效氯60%～64 . 5 % ，性質穩定，易溶于水，殺菌能力強于大多數氯胺類消毒劑。氯制劑溶解于水中后產生次氯酸而具有殺菌作用，殺菌譜廣，對細菌、病毒、真菌孢子、細菌芽孢均有殺滅作用。氯制劑的使用濃度和作用時間、水的酸堿度和水質、環境和水的溫度、水中有機物等都可影響氯制劑的消毒效果。
( 2 ）碘制劑可用于消毒水的碘制劑有碘元素（碘片）和有機碘、碘伏等。碘片在水中溶解度極低，常用2 ％碘酒來代替；有機碘化合物含活性碘25 % ～40 % ；碘伏是一種含碘的表面活性劑，在獸醫上常用的碘伏類消毒劑為陽離子表面活性物碘。碘及其制劑具有廣譜殺滅細菌、病毒的作用，但對細菌芽孢、真菌的殺滅力略差。其消毒效果受到水中有機物、酸堿度和溫度的影響，碘伏易受到其拮抗物的影響，可使其殺菌作用減弱。
